• فهرست شکل‌ها (7)
• فهرست جدول‌ها (9)
• مقدمه (10)
  • کاربردهای مهندسی معکوس پروتکل (10)
  • تعریف مسأله (12)
• مروری بر پژوهش‌های پیشین (14)
  • شناسایی و دسته‌بندی پروتکل‌ها (14)
  • مهندسی معکوس پروتکل (18)
• شناسایی پروتکل (24)
  • روش‌های پیشنهادی برای مرحله شناسایی پروتکل (24)
    • تعاریف (26)
    • روش ACAS (28)
    • تولید تمیز‌دهنده پروتکل (40)
  • پیاده‌سازی و نتایج (41)
  • جمع‌بندی (48)
• جداسازی میدان‌ها (49)
  • تعاریف (49)
  • مسأله یافتن بزرگترین زیردنباله مشترک (50)
    • پردازش سطر به سطر جدول (55)
    • پردازش پیرامون به پیرامون (57)
    • پر کردن قطری جدول (59)
  • روش پیشنهادی (60)
  • جمع‌بندی (76)
• معماری پیشنهادی (77)
  • دسته‌بندی انواع معماری‌های سیستم‌های کامپیوتری (77)
    • معماری SIMD (78)
    • معماری MIMD (79)
  • بررسی معماری‌های مختلف (81)
    • سیستم‌های چندپردازنده یا چند‌هسته‌ای (82)
    • معماری خوشه‌ای (84)
    • GPU (86)
    • پردازنده‌های شبکه (87)
    • پردازنده‌های سیگنال گسسته (90)
    • FPGA (92)
  • معماری مناسب شناسایی پروتکل (92)
  • معماری مناسب برای استخراج میادین (95)
    • موازی‌سازی الگوریتم زیر‌دنباله مشترک (96)
    • معماری پیشنهادی برای استخراج میادین (103)
  • جمع‌بندی (115)
• نتیجه‌گیری و تحقیقات آتی (117)
• پیوست واژه‌نامه انگلیسی به فارسی
• پیوست واژه‌نامه فارسی به انگلیسی
• مراجع (126)