• سرآغاز (9)
  • مقدمه (9)
  • مثالی از میکروآرایه‌ها (9)
  • رویکرد بیزی (12)
  • توزیع تجربی بیز (13)
    • یک مثال و روش محاسبه (15)
  • بررسی تخمین‌گر Fdr (16)
  • شرط استقلال (20)
• روش‌های فراوانی گرایانه (22)
  • مقدمه (22)
  • بررسی p-مقدارها و z-مقدارها (22)
  • بررسی p-مقدارهای تعدیل شده و FWER (25)
  • الگوریتم گام‌به‌گام (27)
  • الگوریتم‌های جایگشتی (28)
• محک نرخ مشاهده‌ غلط (32)
  • مقدمه (32)
  • مشاهدات غلط و درست (32)
  • الگوریتم بنجامینی و‌هاشبرگ (34)
  • بیان بیزگرایی تجربی (37)
  • نرخ منفی اشتباه یا Fnp (41)
  • تخمین زدن مقدار 0 (42)
  • تغییرات و اشکال مختلف الگوریتم BH (43)
    • روش آنالیز معناداری میکروآرایه‌ها یا SAM (43)
• نرخ مشاهده غلط موضعی (47)
  • مقدمه (47)
  • تخمین نرخ مشاهده اشتباه موضعی (47)
  • روش تخمین زدن f(z) (48)
  • مقایسه fdr"0362fdr(z) و Fdr"0362Fdr(z) و Fdr(z) (52)
  • هموارسازی (52)
  • بدست آوردن توان آزمون بوسیله fdr (54)
• توزیع تجربی (58)
  • مقدمه (58)
  • تخمین تجربی توزیع صفر (58)
    • روش اول: روش تطابق مرکزی matching) (central (58)
    • روش دوم: روش بیشترین درست نمایی (60)
  • مقایسه دو روش CM و MLE (61)
  • بررسی چند مثال (61)
    • بررسی اول: study Leukemia (62)
    • بررسی دوم: data Chi-squared (63)
    • بررسی سوم: داده‌های پلیس (64)
    • بررسی چهارم: داده‌های مربوط به ایدز (65)
    • بررسی یک شبیه سازی (66)
  • بررسی علل انطباق نداشتن توزیع نظری توزیع واقعی با داده‌ها (67)
  • مقایسه fdrempو frdtheo (68)
• بررسی داده‌‌های المپیاد ریاضی (70)
  • مقدمه (70)
  • آزمون المپیاد ریاضی (70)
  • داده‌‌های المپیاد (70)
  • بررسی تقلب (71)
  • مدل احتمالاتی (71)
    • آزمون فرض (72)
    • ساختن مدل برای آزمون فرض همزمان (72)
  • یافتن توزیع تجربی (75)
    • بدست آوردن مقدار Fdr (78)
  • محک نرخ مشاهده غلط موضعی (79)
  • یافتن تقلب از بین حالت‌های متشابه (81)
• کتاب‌نامه (84)