• مقدمه (12)
  • تعریف مسئله (13)
  • کاربرد و اهمیت موضوع (14)
  • ساختار پایان‌نامه (16)
• شبیه‌سازی فرآیند رگ‌زایی: تحلیل توپولوژیکی داده‌ها و بررسی تأثیر پارامترهای کلیدی (18)
  • مقدمه (18)
  • شبیه‌سازی فرآیند رگ‌زایی (19)
    • ورودی‌های شبیه‌سازی (19)
    • فرآیند شبیه‌سازی (21)
    • پارامترهای شبیه‌سازی و تنظیمات عددی (22)
    • خروجی شبیه‌سازی (23)
  • تحلیل داده‌ها به روش توپولوژیکی (TDA) (25)
    • مفاهیم پایه ‌ای (25)
    • محاسبه‌ی ویژگی‌های توپولوژیکی (27)
    • بردارهای توصیفگر توپولوژیکی Topological Descriptor Vectors (33)
  • خوشه بندی شبیه‌سازی‌ها (36)
    • مفاهیم پایه‌ای (36)
    • اجرای خوشه‌بندی (37)
  • تحلیل نحوه تاثیرگذاری کموتاکسی و هاپتوتاکسی بر رگ‌زایی (41)
    • تحلیل تأثیر پارامتر کموتاکسی بر رگ‌زایی (41)
    • تحلیل آستانه‌های کموتاکسی و هاپتوتاکسی برای رگ‌زایی (41)
• تعیین دوز بهینه دارو ضد رگ‌زایی (45)
  • مقدمه (45)
  • هدف پروژه (46)
  • تعاریف و مفاهیم (46)
  • ساختار یادگیری تقویتی (50)
    • بازگشت مورد انتظار (Expected Return) و تابع ارزش V (50)
    • دسته‌بندی‌های مختلف سیاست‌ها (52)
    • اجزای مختلف برای یادگیری یک سیاست Policy Components (53)
    • تنظیمات مختلف برای یادگیری سیاست از داده‌ها (54)
  • تولید داده‌های مصنوعی برای بیماران سرطانی گوارشی تحت درمان با راموسیروماب (55)
    • انتخاب ویژگی‌ها و توزیع‌های پیشنهادی (56)
  • مدل PK/PD برای راموسیروماب (58)
    • بخش فارماکوکینتیک (PK) (58)
    • بخش فارماکودینامیک (PD) (59)
  • معرفی الگوریتم یادگیری تقویتی عمیق SAC (67)
    • مقدمه‌ای بر الگوریتم (67)
    • مفاهیم اولیه (68)
    • Soft Actor-Critic (SAC) به‌عنوان نسخه‌ای از Soft Policy Iteration (70)
    • الگوریتم و ساختار :SAC (71)
    • مدل PK/PD و شبیه‌سازی اثرات دارو (75)
• پیاده‌سازی و نتایج (78)
  • طراحی گام های مدل (78)
  • ساختار و مراحل پیاده‌سازی (SAC) (80)
    • ساختار و اجزای کلیدی مدل SAC (80)
    • مراحل اجرای مدل (82)
    • ساختار شبکه عصبی و هایپرپارامترها (83)
  • نتایج پیاده سازی (84)
• نتیجه‌گیری و پیشنهادات برای کارهای آینده (88)
  • نتیجه‌گیری (88)
    • نکات کلیدی مدل پیشنهادی (88)
    • چالش‌ها و محدودیت‌ها (89)
  • پیشنهادها و کارهای آینده (90)
  • نتیجه‌گیری نهایی (92)
• مراجع (93)
• واژه‌نامه (97)