Sharif Digital Repository / Sharif University of Technology
    • [Zoom In]
    • [Zoom Out]
  • Page 
    		 of  0
  • [Previous Page]
  • [Next Page]
  • [Fullscreen view]
  • [Close]
 
طراحی، بیان و ارزیابی ساختار نانوذره‌ی حاوی آنتی‌ژن کاندید واکسن مالاریا به روش self-assembled peptide nanoparticles (SAPNs) و تایید آنتی‌ژنیسیته‌ی آن با استفاده از سرم بیماران مالاریایی
زاهدی، فرهاد Zahedi, Farhad

Cataloging brief

طراحی، بیان و ارزیابی ساختار نانوذره‌ی حاوی آنتی‌ژن کاندید واکسن مالاریا به روش self-assembled peptide nanoparticles (SAPNs) و تایید آنتی‌ژنیسیته‌ی آن با استفاده از سرم بیماران مالاریایی
پدیدآور اصلی :   زاهدی، فرهاد Zahedi, Farhad
ناشر :   صنعتی شریف
سال انتشار  :   1400
موضوع ها :   بیماری مالاریا Malaria Diease شبیه سازی دینامیک مولکولی Molecular Dynamic Simulation ...
شماره راهنما :   ‭06-54273

Find in content

sort by

Bookmark

  • مقدمه (19)
    • اهمیت موضوع (19)
    • بیان مسئله (20)
    • اهداف پژوهش (22)
    • ساختار پایان‌نامه (22)
  • مبانی نظری پژوهش (24)
    • مالاریا (24)
    • توزیع جهانی مالاریا (25)
      • توزیع مالاریا در ایران (26)
    • سیکل زندگی پلاسمودیوم (27)
    • گونه‌های پلاسمودیوم عامل مالاریای انسانی (30)
      • انواع گونه‌های پلاسمودیومی آلوده کننده‌ی انسانی و ویژگی‌های خاص هر گونه (30)
      • ویژگی‌های مشترک گونه‌های پلاسمودیوم (32)
    • علائم بالینی بیماری (33)
    • پاسخ‌های سیستم ایمنی دربرابر پلاسمودیوم (35)
      • فرار ایمنی (38)
    • اقدامات برای کنترل، حذف و ریشه‌کنی مالاریا (38)
      • چالش‌های موجود بر سر راه حذف مالاریا (39)
      • تست‌های تشخیصی (40)
        • چالش‌‌های سر راه تست‌های تشخیصی (41)
      • پیش‌گیری، درمان و توقف انتقال مالاریا (41)
        • چالش‌های پیش ‌رو برای پیش‌گیری درمان و توقف انتقال مالاریا (43)
      • کنترل وکتور (43)
        • چالش‌های سر راه کنترل وکتوری (44)
      • واکسن (45)
        • آنتی‌ژن GCS1 (51)
        • چالش‌های سر راه واکسن (53)
    • انواع واکسن از نظر فناوری ساخت (55)
      • واکسن‌های نسل اول (56)
      • واکسن‌های زیرواحدی (56)
        • واکسن‌های زیرواحدی برپایه‌ی آنتی‌ژن‌های ایمنوژن (56)
        • نانوواکسن‌ها (58)
          • نانوذره‌های پلی‌مری (58)
          • نانوذره‌های غیرآلی (59)
          • نانوذره‌های برپایه‌ی لیپید (60)
          • نانوذره‌های شبه‌ویروسی (60)
          • نانوذره‌های پپتیدی خودمونتاژ (61)
        • معرفی نانوذره‌های پپتیدی خودمونتاژ (61)
          • مفهوم خودمونتاژی (61)
        • طبقه‌بندی نانوذره‌های پپتیدی خودمونتاژ (62)
          • نانوذره‌های پپتیدی خودمونتاژ با صفحات (62)
          • نانوذره‌های پپتیدی خودمونتاژ با ساختار کویلدکویل (62)
        • کاربردهای نانوذره‌های پپتیدی خودمونتاژ در طراحی واکسن (64)
        • مزایا و معایب واکسن‌های نانوذره‌های پپتیدی خودمونتاژ (65)
  • مطالعات پیشین (68)
  • مواد و روش‌ها (73)
    • مواد و تجهیزات استفاده شده در پژوهش (73)
    • روش‌ها (77)
      • آنالیزهای بیوانفورماتیک به‌منظور طراحی واکسن SAPN (78)
        • طراحی توالی الیگومری با قابلیت ایجاد کویلدکویل (78)
        • ویژگی‌های فیزیکوشیمیایی توالی SAPN-PfGCS1 (79)
        • ساختار سه‌بعدی توالی آمینواسیدی (79)
        • بررسی پایداری ساختار سه‌بعدی پیش‌بینی شده (80)
          • شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با گرومکس (80)
          • شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نمدی (81)
        • پیش‌بینی آنتی‌ژنیسیته و آلرژنیسیته الیگومر (81)
        • مونتاژ الیگومرها (81)
      • کلون و بیان ناحیه‌ی ژنی سازنده‌ی نانوذره‌ی پپتیدی خودمونتاژ دارای آنتی ژن هدف (82)
        • سنتز ژن (82)
        • ترانسفورماسیون DNA‌ی نوترکیب به سلول‌های شایسته‌ی E. coli DH5 (82)
        • کشت باکتری‌های E. coli DH5 ترانسفورم شده با پلاسمیدهای دارای ژن SAPN-PfGCS1 (85)
        • استخراج پلاسمید از سلول‌های ترانسفورم شده‌ی E. coli DH5 (86)
        • الکتروفورز پلاسمیدهای استخراج شده دارای ژن SAPN-PfGCS1بر روی ژل آگارز (88)
        • هضم آنزیمی پلاسمیدهای دارای ژن SAPN-PfGCS1با آنزیم‌های محدود کننده و الکتروفورز آن‌ها (89)
        • ترانسفورماسیون پلاسمیدهای دارای ژن SAPN-PfGCS1به سلول‌های بیانی E. coli BL21(DE3) (90)
        • بیان ژن SAPN-PfGCS1در سلول‌های E. coli BL21(DE3) ترانسفورم شده با پلاسمیدهای دارای ژن SAPN-PfGCS1 (90)
        • الکتروفورز نمونه های بیانی بر روی SDS-PAGE (92)
        • بهینه‌سازی میزان IPTG لازم برای القای بیان پروتئین (95)
        • وسترن بلات از پروتئین SAPN-PfGCS1 (96)
        • تعیین غلظت مناسب اوره برای محلول‌های تخلیص و تخلیص پروتئین‌های بیان شده در سلول‌های بیانی E. coli BL21(DE3) حاوی پلاسمیدهای دارای ژن SAPN-PfGCS1 (99)
        • دیالیز پروتئین‌های SAPN-PfGCS1 (102)
        • پراکندگی نور دینامیکی (104)
        • میکروسکوپ الکترونی روبشی گسیل میدانی (104)
        • میکروسکوپ الکترونی عبوری (105)
      • کلون و بیان ناحیه‌ی ژنی سازنده‌ی نانوذره‌ی پپتیدی خودمونتاژ فاقد آنتی ژن هدف (105)
        • PCR ناحیه‌ی ژنی کدکننده‌ی پروتئین SAPN-NC(کنترل) و الکتروفورز محصولات (105)
          • طراحی پرایمر (106)
        • خالص‌سازی محصول PCR از روی ژل آگارز (108)
        • اتصال DNA تخلیص شده به ناقل pGEM T-easy (109)
        • انتقال محصولات لیگاسیون به سلول‌های E. coli DH5 (110)
        • استخراج پلاسمید و هضم آنزیمی جهت تعیین کلون‌های حاوی پلاسمیدهای دارای SAPN-NC (110)
        • همسانه‌سازی ژن SAPN-NCدر پلاسمید pQE-30 و ترانسفورم آن به E. coli M15 (111)
        • غربالگری و شناسایی پلاسمیدهای نوترکیب حاصل از همسانه‌سازی به روش کلونی PCR (114)
        • استخراج پلاسمید نمونه‌های مثبت حاصل از کلونی PCR و هضم آنزیمی آن‌ها (115)
        • بیان سلول‌های بیانی E. coli M15 ترانسفورم شده با پلاسمید pQE-30 دارای ژن SAPN-NC (116)
        • تخلیص و دیالیز پروتئین‌های بیان شده در سلول‌های بیانی E. coli M15 ترانسفورم شده با پلاسمید pQE-30 دارای ژن SAPN-NC (116)
        • آزمون الایزای نمونه‌های دیالیز شده (116)
  • نتایج و تجزیه‌وتحلیل یافته‌ها (120)
    • بیوانفورماتیک (120)
      • توالی الیگومری با قابلیت ایجاد کویلدکویل (120)
      • تایید وجود قطعات با ویژگی کویلدکویلی در توالی (121)
      • تعداد هومومر برای هر ناحیه‌ی کویلدکویلی (122)
      • ویژگی‌های فیزیکوشیمیایی برای توالی SAPN-PfGCS1 (123)
      • ساختار سه‌بعدی توالی SAPN-PfGCS1 (124)
      • ویژگی‌های آنتی‌ژنیسیته و آلرژنیسیته توالی SAPN-PfGCS1 (124)
      • آزمون شبیه‌سازی دینامیک مولکولی (125)
        • شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با نمدی (125)
        • شبیه‌سازی دینامیک مولکولی با گرومکس (126)
      • مونتاژ (129)
    • آزمون‌های تجربی (130)
      • الکتروفورز پلاسمیدهای pET-24a(+) حاوی ژن SAPN-PfGCS1 (130)
      • الکتروفورز برش آنزیمی پلاسمیدهای pET-24a(+) حاوی ژن SAPN-PfGCS1 (131)
      • تایید بیان SAPN-PfGCS1در سلول بیانی E. coli BL21(DE3) (132)
      • تایید بیان SAPN-PfGCS1با استفاده از anti-His antibody و سرم موشی (133)
      • میزان بهینه‌ی IPTG برای بیان در سلول های بیانی (134)
      • تعیین غلظت اوره برای محلول‌سازی پروتئین در زمان تخلیص (135)
      • تخلیص پروتئین SAPN-PfGCS1 (135)
      • دیالیز پروتئين‌های SAPN-PfGCS1 (137)
      • پراکندگی نور دینامیکی (137)
      • میکروسکوپ FESEM (138)
      • میکروسکوپ TEM (138)
      • کلونینگ ژن SAPN-NCدر ناقل کلونینگ pGEM T-easy (139)
      • وکتورهای pGEM T-easy (شرکت پرومگا) (140)
      • ساب‌کلونینگ ژن کدکننده‌ی SAPN-NCدر پلاسمید بیانی pQE-30 (142)
      • بیان و تخلیص SAPN-NCدر میزبان E. coli M15 حاوی پلاسمید نوترکیب SAPN-NCpQE-30- (143)
      • تایید بیان SAPN-NCبا استفاده از anti-His antibody (146)
      • دیالیز پروتئین‌های SAPN-NC (146)
      • شناسایی SAPN حاوی بخش‌هایی از آنتی‌ژن PfGCS1 توسط سرم بیماران آلوده به پلاسمودیوم فالسیپاروم (147)
      • مقایسه‌ی نتایج حاصل از پژوهش پیش رو با مطالعات پیشین (148)
  • نتیجه‌گیری و پیشنهادها (150)
    • نتیجه‌گیری (150)
    • محدودیت‌های پژوهش (151)
    • پیشنهادها (152)
Loading...