Sharif Digital Repository / Sharif University of Technology
    • [Zoom In]
    • [Zoom Out]
  • Page 
    		 of  0
  • [Previous Page]
  • [Next Page]
  • [Fullscreen view]
  • [Close]
 
گذار از حالت پایین به بالا در پروتئین RBD در SARS-CoV-2
طائب، هدی Taeb, Hoda

Cataloging brief

گذار از حالت پایین به بالا در پروتئین RBD در SARS-CoV-2
پدیدآور اصلی :   طائب، هدی Taeb, Hoda
ناشر :   صنعتی شریف
سال انتشار  :   1400
موضوع ها :   زیست فیزیک Biophysics فیزیک ماده نرم Soft Matter Physics اکسایش Oxidation شبیه سازی...
شماره راهنما :   ‭04-54559

Find in content

sort by

Bookmark

  • پیشگفتار (11)
  • مقدمه (13)
    • ویروس‌ها (13)
    • ویروس SARS-CoV-2 (15)
      • اسپایک گلیکوپروتئین (15)
    • پلاسما (20)
      • اثر پلاسما بر ویروس‌ها (21)
      • اثر پلاسما بر پروتئین‌ها (22)
    • طرح مسئله (25)
  • روش کار (27)
    • دینامیک مولکولی (27)
    • دینامیک مولکولی هدف گذاری‌شده (30)
      • روش محاسبه کار انجام شده در شبیه‌سازی‌های هدایت‌شده (33)
    • آماده‌سازی ساختار اولیه (34)
      • گلیکولیزاسیون (35)
      • نرم افزار GROMACS (37)
    • به تعادل رسانی ساختار (39)
    • مرحله پایانی دینامیک مولکولی (40)
    • جزئیات شبیه‌سازی TMD (41)
      • بسته نرم‌افزاری PLUMED (41)
      • اجراهای TMD (42)
    • اکسیداسیون پروتئین اسپایک (43)
    • تحلیل داده‌ها (46)
    • جزئیات نرم‌افزاری و سخت‌افزاری شبیه‌سازی‌ها (47)
  • نتایج (48)
    • مقایسه نوسانات ناحیه RBD در حالت پایین و بالا (48)
    • گذار ساختاری پروتئین اسپایک طبیعی (اکسید نشده) (49)
      • شکست پیوند‌های هیدروژنی حین گذار (49)
      • شکست پل های نمکی حین گذار (52)
    • پروتئین اسپایک اکسیدشده (55)
      • نوسانات RBD (56)
      • شکست پیوند هیدروژنی و پل های نمکی حین گذار (56)
    • مقایسه پروتئین اسپایک در حالت طبیعی و اکسیدشده (58)
      • نوسانات RBD (58)
      • گذار ساختاری پروتئین (59)
      • پیوندهای هیدروژنی و پل های نمکی (60)
      • کار انجام شده حین گذار (64)
    • نتیجه‌گیری (64)
  • جمع‌بندی (66)
  • پیوست (68)
  • کتاب‌نامه (70)
Loading...